El llac Redon (anteriorment anomenat Redó) ha estat el principal lloc de recerca del LOOP des de 1984 i és un dels llacs alpins més estudiats del món. Situat als Pirineus a 2240 m d'altitud, ha estat monitoritzat contínuament durant gairebé 30 anys, amb estudis extensos sobre la seva limnologia, interaccions climàtiques i canvis ambientals. La recerca allà ha avançat la comprensió del canvi global, la contaminació i la dinàmica dels ecosistemes durant els darrers 10.000 anys.

La torbera de la Pleta dels Molières, situada al centre dels Pirineus prop de Vielha, és una de les zones humides àcides més representatives de la regió. Formada sobre granit a 1.720 m d'altitud, acull diversos hàbitats formadors de torba i juga un paper clau en la regulació dels cicles del carboni, nutrients i de l'aigua. La seva hidrologia única la converteix en un lloc valuós per estudiar com responen les torberes de muntanya al canvi ambiental.

El Parc Nacional Aigüestortes i Estany de Sant Maurici, l'únic parc nacional de Catalunya, és un dels ecosistemes alpins millor conservats de la Península Ibèrica, amb més de 200 llacs i una gran biodiversitat. El LOOP hi ha dut a terme una recerca ecològica a llarg termini des del 2004, centrant-se en la vall de Sant Nicolau, un lloc experimental per estudiar la hidrologia, la biogeoquímica i els impactes del canvi climàtic en entorns d'alta muntanya mitjançant xarxes avançades de sensors i programes de monitoratge de l'aigua.

El Districte dels Llacs dels Pirineus, amb més d'un miler de llacs alpins que abasten diverses zones geològiques i climàtiques, és una de les regions lacustres de muntanya més riques d'Europa. Les seves condicions variades el converteixen en un laboratori natural per estudiar com els factors ambientals i humans modelen els ecosistemes alpins. El LOOP ha estudiat aquests llacs des de 1987, construint una base de dades de més de 500 llocs per fer un seguiment dels canvis ecològics a llarg termini.